国科图兰州分馆自1996年与日本科学技术振兴机构建立了资料交换与信息交流的合作关系。主要包括：

① 资料交换方面。由兰州分馆向科学技术振兴机构定期寄送《地球科学进展》、《冰川冻土》、《地震学报》、《中国环境科学》、《环境科学》等14种中文期刊，科学技术振兴机构寄送我馆《科技文献速报》，从2009年4月起《科技文献速报》改为网络版，兰州分馆IP范围内均可使用。

② 信息交流与合作。双方建立了友好的人员互访与信息交流关系。科学技术振兴机构前任理事长冲村宪树一行于2005年10月参加了兰州分馆建馆50周年的庆典活动，兰州分馆孙成权研究员于2001年和2005年两次访问了科学技术振兴机构，马建霞研究员于2006年1月在科学技术振兴机构进行了为期15天的学习。

经过长期合作，双方建立了友好、稳定的交流合作关系。2009年度签订的新合约中，希望通过参加学术交流会以及共同举办国际会议来加强双方的进一步交流合作。